Otomikroskopie je vyšetření uší pomocí mikroskopu. Oproti běžnému vyšetření vidíme podrobněji prostor zvukovodu, plochu a struktury bubínku.
Ušní mikroskopie je důležitá při posuzování vzhledu bubínku, ke zjištění případných atrofických jizev, perforací, retrakčních kaps a podobně.
Mikroskop nám umožnuje přesné cílení nástrojů při chirurgických zákrocích – například při paracenteze (propíchnutí bubínku u středoušního zánětu).